Başlıca kitapları alfabetik sırayla; Din ve Dua, Endülüslü Zidyar Son Anka, Evrensel İslam Ailesi Modern Yalnızlığa Karşı, Kur’an Açısından Korku ve Büyü, Modernleşme Sürecinde Kur’an ve Müteşabihler, İbrahimi Okuyuş olarak sayılabilir.
Ahmet Baydar kitapları; Beyan Yayınları aracılığıyla kitapseverlerle buluşmuştur.
Ahmet Baydar tarafından yazılan son kitap "Kur’an Açısından Korku ve Büyü", Beyan Yayınları tarafından okurların beğenisine sunulmuştur.
